Le musée est situé dans la ville de Louxor, l'ancienne Thèbes. Il se dresse sur la corniche en face de l'hôtel Mina Palace, situé au nord du temple de Louxor surplombant le Nil.

Le musée est destiné à fournir aux visiteurs une compréhension de l'art ancien de la momification. Les anciens Égyptiens appliquaient des techniques d'embaumement à de nombreuses espèces, pas seulement aux humains morts. Des momies de chats, de poissons et de crocodiles sont exposées dans ce musée unique, où l'on peut aussi se faire une idée des outils utilisés

Le musée, situé dans l'ancien centre d'accueil, couvre une superficie de 2035 m² et contient une salle des artefacts, une salle de conférence, une salle vidéo, une cafétéria

La salle des artefacts est divisée en deux parties, la première est un couloir ascendant à travers lequel le visiteur peut jeter un coup d'œil sur dix tablettes tirées des papyrus d'Ani et de Hu-nefer exposés au British Museum de Londres. La plupart de ces tablettes éclairent le parcours funéraire de la mort à l'enterrement. La deuxième partie du musée débutait au fond du couloir et le visiteur pouvait voir plus d'une soixantaine de pièces, qui sont présentées dans 19 vitrines bien avancées.

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Dans ces 19 vitrines, les artefacts sont concentrés sur onze thèmes : Dieux de l'Egypte ancienne, Matériaux d'embaumement, Matières organiques, Fluide d'embaumement, Outils de momification, Jarres canopes, Ushabtis, Amulettes, Cercueil de Padiamun, Momie de Masaharta, Animaux momifiés.