La construction du temple de Khnoum, le dieu créateur à tête de bélier qui a façonné l'humanité sur son tour de potier, a été commencée par Ptolémée VI Philométor (180-45 av. Les Romains ont ajouté la salle hypostyle, la seule partie du temple qui est fouillée et peut être visitée aujourd'hui, avec des sculptures bien conservées datant du IIIe siècle après JC.

Le temple de Khnoum repose aujourd'hui dans une fosse de 9 m de profondeur, qui représente 15 siècles de sable et de débris du désert, accumulés depuis son abandon à l'époque romaine. La majeure partie du temple, de taille similaire aux temples d'Edfou et de Dendara, est encore couverte par la vieille ville d'Esna. Un quai reliant le temple au Nil a été construit par l'empereur romain Marc Aurèle (161-180 après JC).

La porte centrale mène au vestibule sombre et atmosphérique, où le toit est soutenu par 18 colonnes avec des chapiteaux floraux merveilleusement variés en forme de feuilles de palmier, de bourgeons de lotus et d'éventails de papyrus ; certains ont également des grappes de raisin, une touche romaine distinctive. Le toit est décoré de scènes astronomiques, tandis que les piliers sont recouverts de récits hiéroglyphiques des rituels du temple. À l'intérieur des coins avant, à côté des portes plus petites, se trouvent deux hymnes à Khnoum. Le premier est un hymne matinal pour réveiller Khnoum dans son sanctuaire ; le second est un merveilleux « hymne à la création » qui le reconnaît comme créateur de tous, même étrangers : « Tous sont formés sur son tour de potier, leur discours différent dans chaque région mais le seigneur du tour est aussi leur père.

Sur les murs, des empereurs romains déguisés en pharaons font des offrandes aux dieux locaux d'Esna. Le mur nord présente des scènes de l'empereur Commode attrapant des poissons dans un fourré de papyrus avec le dieu Khnoum et, à côté, présentant le temple au dieu.

Le mur du fond, au nord-est, construit pendant la période ptolémaïque, présente des reliefs de deux pharaons ptolémaïques, Ptolémée VI Philométor et Ptolémée VIII Euergète (170-116 av. Un certain nombre d'empereurs romains, dont Septime Sévère, Caracalla et Geta, ont ajouté leurs noms près de la porte arrière de la salle. A l'extérieur, une pompe souterraine peine à éloigner les eaux souterraines de l'ouvrage