Le temple a été construit sur des ruines beaucoup plus anciennes remontant à Ramsès III, et a été construit au cours de 180 ans sous divers dirigeants pendant la période ptolémaïque en Égypte. Cette période représentait une époque de domination grecque; chaque pharaon était un descendant de Ptolémée, un général de l'armée d'Alexandre le Grand qui avait pris le contrôle de la région quelques siècles avant la construction du temple. Cependant, le temple incarne l'architecture traditionnelle de l'Égypte ancienne et est en grande partie exempt d'influence hellénistique. Le temple lui-même est dédié au culte du dieu égyptien Horus, qui a souvent été fusionné avec le dieu grec Apollon. En fait, la ville d'Edfou a été rebaptisée Apollonopolis Magna pendant la domination gréco-romaine en Egypte